Bertioga, a cidade mais jovem da Baixada Santista, é uma das poucas do litoral paulista com todas as praias aprovadas pela Companhia Ambiental do Estado de São Paulo (Cetesb) para o banho de mar. A Cetesb avalia regularmente as condições das praias e publica semanalmente um boletim sobre a balneabilidade de cada uma delas. A balneabilidade se refere à qualidade das águas destinadas à recreação, como natação e mergulho.
Segundo a Cetesb, um dos principais critérios para classificar as praias são os aspectos sanitários, como a presença de sistemas de coleta e disposição de resíduos domésticos gerados nas proximidades.
O boletim da Agência do Governo do Estado de São Paulo analisa praias em 15 cidades ao longo de todo o litoral paulista. Em Bertioga, os pontos avaliados são: Boraceia, Guaratuba, São Lourenço e Enseada, nos bairros Indaiá, Vista Linda, Rio da Praia e Centro. Toda a extensão do mar no município de Bertioga recebe a bandeira verde, indicando águas limpas.